Cada cuanto ejecutas los agentes?
Existe un problema conocido, debido a un bug de la librería de Perl que hace la conexión contra la base de datos, en su versión 2.9003 (mira
http://sourceforge.net/tracker/index.php?func=detail&aid=1501805&group_id=155200&atid=794852), pero puede que este no sea el problema.
Otra pregunta es, el problema viene desde el principio o sólo desde que has instalado algún agente en concreto?